“毛竹基因組測(cè)序研究”通過(guò)國(guó)度林業(yè)局驗(yàn)收

發(fā)布時(shí)間：2024-01-05 07:11:38 編輯：潤(rùn)博園林人氣：

【導(dǎo)讀】

毛竹是天下上最重要的木本竹之一，具有重要的生態(tài)和經(jīng)濟(jì)代價(jià)，在山區(qū)脫貧致富中發(fā)揮著重要浸染......……

7月11日，林業(yè)公益性行業(yè)科研專項(xiàng)重大項(xiàng)目“毛竹基因組測(cè)序研究”通過(guò)國(guó)度林業(yè)局驗(yàn)收。項(xiàng)目由國(guó)際竹藤中心主任江澤慧主持，中國(guó)林科院、國(guó)際竹藤中心和中國(guó)科學(xué)院國(guó)度基因研究中心3家單位配合完成。

毛竹是天下上最重要的木本竹之一，具有重要的生態(tài)和經(jīng)濟(jì)代價(jià)，在山區(qū)脫貧致富中發(fā)揮著重要浸染，全球每年竹產(chǎn)品國(guó)際商業(yè)額近20億美元。毛竹全基因組測(cè)序工作的完成，填補(bǔ)了禾本科植物竹亞科基因組的空缺，將對(duì)包羅竹類植物在內(nèi)的一系列重要物種的基因成果、分子育種、物種進(jìn)化及其他相關(guān)規(guī)模的研究發(fā)生敦促浸染。這項(xiàng)研究由我國(guó)科研人員自主完成。

項(xiàng)目回收第一代測(cè)序技能和第二代高通量測(cè)序技能相團(tuán)結(jié)的計(jì)策，得到了毛竹2.05Gb基因組草圖，包圍毛竹全基因組的95％，預(yù)測(cè)出31987個(gè)高度靠得住性的基因，成就于2021年2月24日頒發(fā)在國(guó)際權(quán)威雜志《NatureGenetics》上。這是截至研究成就頒發(fā)時(shí)，天下上利用第二代測(cè)序要領(lǐng)測(cè)定的、布局最為巨大的高檔植物基因組之一。

項(xiàng)目操作較量基因組學(xué)要領(lǐng)，通過(guò)對(duì)多物種的直系同源基因家屬的聚類與進(jìn)化闡明，首次闡發(fā)了毛竹于5000萬(wàn)年前從禾本科植物中分化出來(lái)，繼而于12021年前形成了四倍體，最后演釀成現(xiàn)代二倍體毛竹的進(jìn)化汗青。同時(shí)，展現(xiàn)出二穗短柄草比水稻與毛竹的親緣干系更近。項(xiàng)目組構(gòu)建了毛竹不同器官、不同發(fā)育時(shí)期材料的全長(zhǎng)cDNA文庫(kù)，并測(cè)序組裝得到了10608條全長(zhǎng)cDNA序列和約38000條EST序列。成立了包羅毛竹開(kāi)花時(shí)期等多范例材料的基因表達(dá)譜，首次從基因組層面臨包羅快速生長(zhǎng)和開(kāi)花調(diào)控在內(nèi)的毛竹非凡生理進(jìn)程的形成和機(jī)理舉辦了闡明。

項(xiàng)目成立了天下上第一個(gè)竹子基因組闡明與注釋數(shù)據(jù)庫(kù)，提供了較量基因組、卵白-卵白互作、代謝通路和組學(xué)信息可視化闡明東西，對(duì)促進(jìn)竹類植物研究具有重要代價(jià)。

由9位院士專家構(gòu)成的驗(yàn)收委員會(huì)平等同意通過(guò)驗(yàn)收，認(rèn)為項(xiàng)目成就為毛竹及其他竹類植物的生物學(xué)研究奠基了堅(jiān)硬基本，具有重要的科學(xué)代價(jià)和應(yīng)用前景。

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