紅豆杉大多采取種子繁殖。11月種子成熟后即可采收，之后將肉質種皮洗濯清潔晾干，隨即用濕沙層積埋藏在背陰干燥處，上面覆蓋塑料膜及草簾。夏秋季應每月翻動種子兩次，到次年3月初即可播種育苗。苗床應選擇背風且排水良好的微酸性沙壤土地塊，床寬1米，溝寬40厘米，器械向起高垅，垅兩側埋25厘米高、4厘米厚的鋼板，深10厘米。床土要求深翻并精細耕作，施入呋喃丹防治地下蟲害。用蛭石、河沙、泥炭、園土各一份，并加入多菌靈或甲基托布津等殺菌劑，夾雜成基質填入鋼板內，與側板平中心高出3～5厘米。覆上塑料膜密封熏蒸3至5天即可播種。種子均勻散播于床面上，每平方米播種量在200粒左右，播種后用木板略壓平，蓋1至2厘米厚的夾雜基質土，覆蓋草簾或塑料膜保溫保濕。遇天氣干燥應適當噴水，一般40天后可發芽出苗。此時應去掉塑料膜或草簾，并在苗床上方搭設2米高的遮陰棚，上蓋遮陰網防止陽光直射。保持苗床濕潤，遇雨天應搭低拱棚并蓋塑料膜防止苗床水分過多。做好苗床的排水透風工作，實時防治病蟲害。幼苗期每隔10天施一次腐熟淡餅肥水，忌用化肥和濃肥。幼苗經過一年的全心養護管理，苗高可達15～25厘米，并有2～3個分叉枝。4月上旬可舉行移植。栽植地應選擇背風、干燥、富含腐殖質的微酸性沙壤地，深翻20厘米，每平方米施5公斤腐熟有機肥。起高垅，挖深溝，垅寬100厘米，溝寬30厘米。每垅種5行，行距20厘米，株距15厘米。移植宜選在陰天，應隨移隨種，需帶土球移栽。移栽后馬上澆一次透水，并在上面搭2米高的遮陰棚，晴天蓋遮陰網，陰雨天及晚上可將其去掉。生長期加強肥水管理，一般每隔10天施一次腐熟餅肥水。做好病蟲害防治管理。夏天加強遮來臨溫工作，需要時采取噴水降溫，以締造冷涼濕潤環境利于苗木生長。紅豆杉既是制作高等家具的上等質料，又是極具醫療價值的藥材，更是園林綠化的優良樹種，隨著其人工繁殖和人工種植技術的成熟和生長，紅豆杉的應用范圍將加倍普遍。
用紅豆杉種子繁育苗木時，要注重種子的儲存方式，要沙種混藏或控溫處理，這對越冬后出芽和打破休眠習性，具有很好的效果。播種前要搓傷種皮、溫水浸種、藥劑激素處理。出苗后遮陰是育苗的關健。可防止苗木高溫灼燒保持濕潤、透光度在40%為宜。東北紅豆杉和南方紅豆杉出苗率均可到達70～80%，要求出苗溫度高于15度。
實生苗幼苗的動態生長情況是：實生苗的株高和莖粗在出苗的前兩年生長緩慢，株高一般年生長10cm左右，移栽一年以后生長加速。3～5年 年增添量可達20～30cm。