斑馬紋病
劍麻感病初期，葉面上出現黃豆大小淺綠色水漬狀病斑，在溫度、濕度適宜的條件下迅速擴展，每天可擴展2~3cm。感病中后期，由于晝夜溫差的影響，病斑繼續生長成深紫色和灰綠色相問的同心環帶，邊緣綠色至黃綠色，中心逐漸變黑。當病斑老化時，壞死的組織皺縮，呈深褐色和淡黃色相間的同心輪紋，形成特有的斑馬紋葉斑。剖開病莖，病部呈褐色，并在病健接壤處有一條顯著的紅色分界線。未張開的嫩葉在葉軸上腐爛，有不規則的褐色輪紋，有惡臭。有同心環帶、病處與健處有一條顯著的紅色分界線、有惡臭氣息是斑馬紋病的三大特征，也是斑馬紋病區別于其它病害的重要依據。
防治措施：
1、以農業綜合種植措施為主，藥劑為輔；
2、搞好以“治水”為主的麻田基本建設，對低洼、積水、易發病的地區，要起畦栽植，修剪防沖刷溝、排水溝、隔離溝，以防病害伸張；
3、做好種苗防病工作，外來種苗要經過嚴格檢疫，苗期發病時要實時處理；
4、不要偏施氮肥，要增施鉀肥，有斑馬紋病發生的地區麻渣必須經過堆漚充分腐熟后才能施用；
5、雨天不育苗、不起苗、不定植、不除草、不割葉；
6、每年4月開始。經常檢查易發病麻田，實時發現病株并妥善處理，每年冬旱季對發過病的麻田，把所有病葉、枯葉、死株等清出麻田，集中銷毀或埋掉，消毒病穴。
莖腐病
黑曲霉菌是莖腐病的病原菌，感病植株葉片褪綠、失水、枯萎、下垂，病葉呈淺綠色，病健接壤處有紅色暈圈，有酒精味。
防治措施：
1、調整割葉期。莖腐病發生在高溫期.割葉采取避病措施，在不影響正常加工情況下，將割葉期盡管放置在11月至翌年2月；
2、增添石灰，調治鉀、鈣比例。除正常施肥管理外，對病區適當增施石灰，以提高鈣含量，加強植株抗性；
3、藥劑防治：易發病田在高溫期割葉，割葉后2d內用40%滅病威150~200倍溶液噴割口，每公頃用300kg藥液量。
黃斑病
由于晝夜溫差過大，一般大于10℃以上，或大氣水分與植株體內水分不協調，造樂成效代謝酶失常引發此病，常發生在秋冬交季的9~10月份。黃斑病發生在成熟的葉片上，呈黃色或黃綠色，病斑不擴展不伸張，一般經過浮腫、變色和干皺期。在干皺期葉表皮與纖維一起干皺，纖維不星散、不腐爛。
防治措施：合理密植，增施石灰或殼灰，提高植株鈣的含量，葉片鈣的含量達2.5%以上；套種豆科作物，營造防護林。
白斑病
發病機理同“黃斑病”。白斑病發病初期葉片褪綠，呈灰白色，病斑極不規則。在正常情況下，幾天之內葉片由褪綠充水，經失水變色，生長到干皺，干皺后纖維不星散、不腐爛。
防治措施同“黃斑病”。
帶枯病
由于土壤缺鉀引起。發病初期，葉頸、葉基后頭出現許多較小淺綠色或黃褐色的黑點，今后葉基褪綠，黑點逐漸變為紅褐色。中期黑點連在一起，壞死組織萎縮，形成形狀紛歧、下凹的塊狀斑。后期壞死斑塊在葉面上橫向生長，形成一條寬約3~5cm的帶狀病斑，葉片由此斷折，較后卷枯死亡。
防治措施：施好施足鉀肥或火燒土，阻止套種甘薯或木薯等耗鉀作物。
紫色先端卷葉病
與土壤的磷、鉀、鈣有關，重要由于缺磷引起。多數集中出現在老葉和成熟葉的葉片先端，病葉邊緣呈紫色，葉緣雙方向中卷曲。卷曲的葉片內有時有粉蚧出現，常誤為蟲媒病原菌病害。
防治措施：增施磷肥和鈣肥。
褪綠斑駁病
由土壤、植株缺鈣和土壤強酸性引起，病斑較大，呈黃色，圓形或橢圓形。病斑邊緣不顯著，分布于老葉和成熟葉的葉面上，大小相似、數目不等，病葉穩定色也不皺縮。
防治措施：增施石灰、殼灰或含鈣量較高的鈣肥，降低土壤酸度，以提高土壤和植株鈣的含量，從而到達防治效果。
炭疽病
此病發生在葉片的正反兩面，初期葉片外面發生淺綠色或暗褐色稍微皺凹陷的病斑，以后逐漸變為黑褐色。后期病斑不規則，上面散生許多小黑點。干燥時病斑皺縮，纖維易斷裂。
防治措施：可用1%波爾多液或用0.5%~1%多菌靈防治。
葉斑病
有兩種。一種由半知菌引起，在葉的兩面發生玄色、圓形至長圓形的病斑，表皮下有裂口。另一種由子囊菌引起，在葉片上出現大的褐色至玄色的黑點，圓形至卵形，渙散或聚集在一起，在葉的兩面都可發生。病斑組織腐爛，易與變色的纖維星散。
防治措施：可用0.5%~1%多菌靈或甲基托布津防治。
褐斑病
較初在葉面上出現淺色、橢圓形、邊緣不顯著，直徑1mm左右的病斑，隨后擴大成褐色凹陷的大病斑，上面發生小黑點。病菌可以穿透葉片生長，使纖維受到嚴重的損害。可用0.3%~1%多菌靈或波爾多液防治。
梢腐病
感病植株1/3以上的先端腐爛，葉組織與纖維星散，葉肉腐爛后，留下白色的纖維變脆逐步腐爛，植株呈掃帚形。可用0.1%~0.5%的90%疫霜靈防治。
叢葉病
由蚜蟲、切葉象甲等昆蟲為害引起，發病植株心葉畸形叢生，沒有葉軸。
防治措施：用40%樂斯本乳油1500倍，25%吡蟲啉可濕性粉劑1000倍或40%樂果1000噴殺，殺死媒蟲，實時清除病株。

褐色卷葉病
粉蚧為害劍麻葉片后，葉片先端出現褐色卷葉干枯，嚴重時整株卷葉干枯。
防治措施：用600~1000倍40%氧化樂果和40%速殺蚧殺死害蟲，實時清除病株。

煤煙病
蚜蟲、粉蚧等昆蟲為害劍麻葉片時，其玄色滲出物沾在葉片上，形成一層煤煙，稱之為煤煙病。
防治措施：用800~1000倍40%氧化樂果和25%吡蟲啉多次噴殺，殺死源蟲。
新菠蘿粉蚧
屬于外來物種，常在干旱的冬季暴發盛行，蟲體10節，灰白色，兩性生殖，無卵期，20多天一代。重要藏匿于葉基部、未張開的心葉及根系中，為害嫩葉后再為害老葉，造成劍麻煤煙病、葉片先端褐色卷葉干枯或整株葉片干枯。
防治措施：
1、阻止從疫區引進種苗。
2、定期觀測，在易發生季節用1：800倍50%甲胺膦(更換品)與20%石硫合劑舉行預防。
3、發生蟲害時依次用1000倍40%氧化樂果和25%吡蟲啉、800倍45%馬拉硫膦和40%速殺蚧、600倍40%氧化樂果和40%速殺蚧每15天撲殺一次，延續噴殺3~5次；地下根系蟲體用3%呋喃丹顆粒灌殺，并將蟲株清除深埋或集中銷毀。
4、利用瓢蟲、草蛉等天敵舉行生物防治。
切葉象甲
為害劍麻嫩葉和葉軸，在葉基橫切嫩葉、環切葉軸，切口平整，類似人為切割。經為害過的植株新抽出的葉片叢生畸形扭曲。
防治措施：可用25的吡蟲啉和40%樂果1000倍。
根結線蟲
為害劍麻的根系，造成根系單個或串狀腫大形成根結，經為害的植株營養不良，植株因缺素顯示缺素癥狀逐漸蔫萎干枯。
防治措施：用3%的呋喃丹或5%特丁膦顆粒防治。
蚜蟲
為害劍麻嫩葉和成熟葉片，造成煤煙病和叢葉病。
防治措施同煤煙病、叢葉病的防治。
紅蜘蛛
重要為害劍麻的嫩葉，造成葉片黑點褪綠變黑，影響植株的生長和葉片質量。
防治措施：用73克螨特乳油1000倍，8%中保殺螨乳油1000倍，8%的速撲螨乳油1000倍舉行防治。