芍藥在生長歷程中，容易遭受黑斑病、白絹病、銹病及蠐螬、蚜蟲、紅蜘蛛等病蟲害，必須注重加強防治。
黑斑病 發病初期噴施65%代森鋅可濕性粉劑500倍液，有一定效果；花后、發病前，每隔7至10天噴一次等量式波爾多液加以防治，直至秋后為止，這樣做雖然不能根治這種病害，但是能減輕癥狀；集中銷毀枯枝、病枝等；用1誜100福爾馬林液對土壤舉行消毒；3至4年后不再連作。
白絹病 舉行土壤更換或消毒；發病初期剪除病株，集中銷毀，并對病株周圍的土壤用升汞、石灰、水(1：1.5：1500)液澆灌；發病前定期噴施50%多菌靈可濕性粉劑500倍液或50%托布津可濕性粉劑500倍液。
銹病 定期噴施65%代森鋅可濕性粉劑500倍液或石硫合劑0.3至0.4度液，每隔10至15日噴一次，延續噴3至4次，可取得一定效果。
蠐螬 早春用1%敵百蟲液或每平方米用呋喃丹20克至30克澆灌土壤舉行消毒；深翻土地，使越冬蟲卵凍死。
蚜蟲 消除越冬雜草；發生危害時，噴40%樂果乳劑3000倍液。
紅蜘蛛 除草、積肥，清除越冬蟲卵，降低初期危害的蟲口；噴施20%三氯殺螨砜可濕性粉劑1000倍液或40%三氯殺螨醇乳劑2000倍液；夏天噴灑波美0.2至0.3度石硫合劑，噴灑后6日至7日，需要再噴一次，并實時噴水清算葉片。