重慶南山植物園山茶園首次入選“首批國家花卉種質資本庫”，成為天下37個花卉種質資本庫基地之一。其中西部僅有2家：重慶南山植物園國家山茶種質資本庫和云南昆明野生蘭國家蘭屬種質資本庫。

茶花被譽為中國傳統十臺甫花，我國西南地區是天下山茶屬植物起源及多樣性分布中心。茶花在川渝地區已有1300多年的栽植歷史，長期的栽植、馴化、交流，形成了獨具特色的川山茶栽植類群。重慶市政府于2021年7月23日將茶花定為重慶市市花。茶花不懼寒霜，經冬怒放，花開艷麗，熱情似火，恰如重慶人的性格，已成為重慶文化精神的重要代表符號。

重慶南山植物園自2021年建園開始，就注重茶花品種的網絡、展示、引種和栽植研究工作。尤其在川山茶資本保育和研究方面的工作，更是取得了顯著成就，形成了自身特色和優勢，山茶資本保育程度天下領先，在天下甚至天下有了較大影響力。2021年，重慶南山植物園山茶專類園被國際茶花協會評選為“國際卓越茶花園”。南山植物園山茶專類園已成為國內川山茶品種類型網絡展示較豐富的專類園，占地面積105畝，建有“市花園區”、“古茶苑區”、“名優茶花園區”、“桂池水景區”、“茶文化展示區”、“茶科植物多樣性展示區”等六大景區，近20個景點，網絡川山茶傳統品種110個。此外還保育有華東紅山茶、云南山茶、茶梅品種、金花茶品種、現代雜交茶花品種及山茶原生種總計580個品種(中)、5萬余株。百年以上的川山茶古樹跨越200株，樹齡300年以上的“紫金冠”、“金頂大紅”、“三學士”等，更是被視為鎮園之寶。