牡丹花芽黑褐色干枯有可能是真菌或根結線蟲危害引起的，也可能是一些生理性因素造成的，如土壤中缺少鉀元素、太過干旱、早春氣溫太低、栽植過深、土壤貧瘠、太過遮蔭等。 防止牡丹花芽變褐干枯的措施：要查明緣故原因，有的放矢。 如果是生理性病害，就要加強種植管理，選擇松散肥沃、排水良好的沙壤土，合理供水，阻止太過干旱。 如果是真菌引起的，可用l：1：160等量式波爾多液或45％代森銨水劑1000倍液等噴灑。 如果是根結線蟲引起的，可以看到牡丹根上發生瘤狀突起，大的如黃豆，小的似小米，后期瘤狀物變褐腐毀，對牡丹有較大危害。發現后，應將病株拔除銷毀，并用藥劑舉行土壤消毒。土壤消毒藥劑可選用40%五氯硝基苯粉劑與80%代森鋅可濕性粉劑等量夾雜，每平方米用藥8～10克；也可選用福爾馬林溶液(每平方米5毫升)。