在廣州地區，番木瓜育苗重要在秋冬舉行，要想育出壯苗，提示大家下午是做好防寒、防病蟲與煉苗工作，并加強肥水管理。

一般用塑料營養袋育苗，營養袋的規格為高20厘米、寬15厘米。營養土的身分是9份塘泥、1份腐熟禽畜糞。充分夾雜后裝入營養袋，每袋放入2-3粒番木瓜種子。如果要節約種子，可以先讓種子置于32-35 ℃條件下保溫保濕，舉行催芽處理，發芽后每個營養袋放一粒種子。一般播種不宜太深，播種后覆上一層土壤即可。當瓜苗出土后，可以再覆上一層垃圾及腐熟豬牛糞夾雜的肥土，并保持土壤濕潤，噴1000倍托布津或300倍膠體硫，每隔10天噴一次，共噴2-3次，以削減病害的發生。當出現2-3片真葉后，適當削減淋水次數，促根深生，每10天施1次水肥，如腐熟的稀釋10倍的尿水。

由于在秋冬舉行育苗，以是要做好防寒工作。一般蓋塑料薄膜防寒，要求棚內溫度不高于35℃，不低于5℃。日間溫渡過高時，要掀起薄膜，以便吸收陽光和散熱降溫，晚上蓋好薄膜防寒。當幼苗長出5片真葉，同時夜溫不低于8℃時，要注重煉苗，也就是逐漸打開薄膜，少施肥少淋水，這樣，使苗木矮壯、根系發達。當苗高達20厘米左右，就可以出圃。