桑樹苗的病害重要有桑白絹病和桑猝倒病兩種。這兩種病均為害桑苗的根部和近地面的干基部，能使苗木死亡，造成出苗率低。
桑白絹病為害重要是無性繁殖的嫁接苗和插條苗，尤其在砂藏預措期的高溫多濕的環境下為害嚴重。發病初期接穗、插穗的皮層變色，呈油浸狀，后皮層腐爛并生有白色絹絲狀的菌絲體，較后結成油菜籽似的栗褐色的菌核，病苗一般不能成苗出圃。防治應做如下工作：
1、在砂藏預措或大田定植溝用的砂均要選用新鮮的河砂，有條件的較好將河砂用福爾馬林100倍液逐層噴濕，然后用農用尼龍膜覆蓋24小時，才開膜備用，能起到殺菌作用。
2、對嫁接苗舉行預措或大田定植之前和對插條穗采取高錳酸甲2000倍液舉行浸3－4小時，然后用清水沖清潔，能起到刺激愈合發根作用又兼清潔消毒作用。
3、在預措期間或在苗圃地發現有白絹病苗時，必須實時清除，立刻噴布或淋施50％多菌靈可濕性粉劑500倍液或40％滅病威懸浮劑300倍液。每隔一周重處理一次，效果更好。
桑猝倒病重要為害有性繁殖的實生苗，一般在桑種子萌發后至5葉期，發病較為嚴重。幼苗初發病時生長緩慢，呈多中心分布發生，很快擴展伸張，厥后在幼苗的近地面基部2－3厘米處出現淺紅褐色的病斑，病部位皮層壞死，使幼苗呈失水狀枯萎，由于苗幼木質部不充分，故呈軟腐猝倒而死，并會很快擴展到整片苗圃。預防該病應做如下工作：
1、選用多年栽水稻田做苗地，或對苗地舉行多次翻耕曬透，也可對苗地舉行穴施氨水每公頃800－1000公斤或淋施25倍新鮮石灰水。
2、在苗地初發病時要實時拔除病苗，噴布或淋施50％百菌清可濕性粉劑1000倍液或50％多菌靈可濕性粉劑500倍液。