紅豆杉腐霉病病原屬真菌鞭毛菌亞門，營養體多數為無隔菌絲體，少數為原質團，無性繁殖發生游動孢子；有性生殖發生卵孢子或休眠孢子。孢子囊球狀，萌發時發生泡囊；原生質轉入泡囊內形成活動孢子，藏卵器內含一個卵孢子。此菌能在冷濕環境中浸染危害，也能在天氣炎熱濕潤時瘋狂盛行。當高溫、高濕時，它的發病率高。此病5~8月發病較嚴重。土壤含氮量高，可加重此病的發生。
癥狀
植株較直觀的顯示就是根莖腐爛。在南方紅豆杉上，此病在植株根、莖上都有發生，屬于軟腐中的根腐和莖腐，地上部份枯死而不倒狀，也稱為立枯。一般顯示為霉狀物，但在病部很難發現霉狀物。

傳播途徑
土壤和病殘體中的卵孢子是較重要的初侵染源，人工作時的對象和人攜帶病原物極易感染。此病在南方紅豆杉上顯示為零星狀分布。

防治方式
可以用甲霜靈錳鋅加75%百菌清500~1000倍液噴霧防治；也可混入一些微量元素，以增添植株自己的抗病性。針對病情可逐漸增添藥劑量。一般7~15天噴施一次，病情嚴重時可縮短至4~5天一次。

紅豆杉腐霉病和紅豆杉立枯絲核病區別
外觀診斷上，立枯絲核病顯示青枯屬萎蔫的一種，就是葉片脫水，葉片含葉綠素；病株從侵染到展現時間很短。腐霉則展現為立枯；地上部份是逐步失水黃化枯死，且主根病斑是水漬狀小黑點，外面軟腐；側根發病后褐變而腐爛。而立枯絲核病在主根和側根上有顯著的白色索狀物，而且充滿病株的莖和根。
病原物內部結構看，腐霉病營養體的菌絲體是無隔的，而立枯絲核病營養體的菌絲體是有隔的白色索狀物。立枯絲核菌有性繁殖發生坦孢子，腐霉病有性繁殖發生卵孢子。